Хроники Кайдана 2 продолжает сюжет первой части о приключениях сталкера Кайдана. Во второй части игрокам предстоит помочь Юрию Семецкому и раскрыть тайну кинотеатра Прометей в Припяти, но не в одиночку, а с группой майора Дегтярёва, которая развернула свой штаб в одной из лабораторий Восточной Припяти.

Сталкер День одиночки представлен как сюжетная модификация, действия которой происходят на двух локациях Кордон и Болота. В центре событий оказался опытный сталкер одиночка Тихий, которому предстоит выполнить особенное задание бармена Пороха. Кроме нового сюжетного наполнения, игра приобрела интегрированный оружейный пак, новую озвучку и персонажей.

Научный Подход представлен разработчиками как небольшой сюжетный аддон для мода Новое Время, рассказывающий историю от лица научного сотрудника Дяди Лёши. Основная сюжетная линия, имеет пошаговый и довольно линейный характер прохождения, готовая совершенно по-новому представить события происходящие в модификации Новое Время.

Зона Поражения Новая Эра представлена как модификация с переосмысленной сюжетной линией, где кроме кардинально пересмотренного сюжетного наполнения, игра приобрела новую визуализацию, в виде высококачественного пака текстур, новых игровых уровней и интегрированного оружейного пака. Главным героем оказавшимся в гуще событий спецоперации, проводимой в Зоне, стал легендарный Стрелок. Ему не только предстоит остаться в живых, но и спасти три группы военных, высадившихся в районе ЧАЭС.

Сталкер Боль Прошлого представлен как сюжетное переиздание ранее вышедшего проекта Грехи Прошлого Пролог, построенного на платформе игры Сталкер Зов Припяти. Центральными изменениями в игре стали кардинально переработанная сюжетная линия и наличие новых игровых уровней. Кроме изменений сюжетного плана, игра приобрела обновленную графику на базе аддона Atmosfear 3 и адаптированный оружейный пак. Наряду с новыми персонажами, модификация получила большое количество второстепенных заданий и квестовых цепочек, ведущих игрока к неожиданной развязке в финале.