После ликвидации Могильщика, Юз-баши сообщает главному герою, о гибели группы Водяной Крысы. Прибыв на насосную станцию Грек, обнаружит перебитую группы Водяной Крысы и рядом стоящего Юз-баши. После разговора с ним, появляется задание найти Дедмена, однако точного местонахождения не указано, а в описании к заданию сказано, что необходимо выдвигаться на последнее место встречи с Дэдменом.

Прохождение квеста "Незаконченная миссия" в моде Последний Сталкер, ориентирована на поиск схрона Могильщика, который может пролить свет на местонахождение его хозяина. После полного уничтожения группировки Могильщика, ему удалось скрыться.

Сюжет мода Последний Сталкер построен таким образом, что после окончания основной сюжетной линии игрок может продолжить играть во фриплее и выполнять квесты. Одним из таких квестов является поиск тайника Краснова с аккумуляторами для Ворлока.

Модификация Последний Сталкер имеет в своем арсенале не только увлекательный сюжет, но и множество квестовых персонажей, одним из которых является Лёша Борман. Данный персонаж напрямую связан с квестом "В законе", где главному герою Греку, предстоит найти Лёшу Бормана и передать ему решение сходки.

Прохождение мода Последний Сталкер имеет множество непредсказуемыми сюрпризами и с одним из них главному герою придётся столкнуться на локации Болота, когда необходимо выйти на связь с Танкистом. Связь с ним осуществляется с помощью радиосканера и в момент выполнения квеста Разборка на Болотах, выясняется что радиосканер поврежден и тут у многих игроков возникает закономерный вопрос как связаться с Танкистом и где найти исправный радиосканер.

Последний Сталкер стал финальным проектом серии Апокалипсис, как и прежде автор сделал ставку на интересный сюжет и захватывающие квесты, проходя которые главный герой попадает в невероятный водоворот событий. Львиная доля заданий присутствующих в основной сюжетной линии и фриплее косвенно или напрямую связано с открытием кодовых замков, дверей, сейфов и тайников.

После официального релиза S.T.A.L.K.E.R.: Lost Alpha, разработчики не стали лишать игроков уникальной возможности использования консольных команд. Огромным преимуществом такого инструментария, является выполнение команд и запуск скриптов прямо во время прохождения. Управление через консоль, полностью исключает конфликты и вылеты во время игры, так как исключает установку сторонних модификаций и использует лишь штатные возможности движка X-Ray.

После появления главного героя Dead Air на Кордоне, вы неминуемо столкнетесь с выполнением квестов от персонажей находящихся в лагере новичков. Однако в расположенном неподалеку АТП, одновременно являющейся базой бандитов, есть персонажи со своими заданиями, одним из таких является бандит Степуха Банан.

Играя в Dead Air, по аналогии с оригиналом теней Чернобыля, многие игроки отправляются на Армейские склады в надежде попасть на базу Свободы. Однако продвигаясь через смертельные аномалии, враждебно настроенных сталкеров и опасных мутантов к своему разочарованию обнаруживают брошенную и кишащую монстрами базу.

Инструменты в Dead Air становятся для игрока не отъемлемой частью геймплея и их нахождение значительно расширяет возможности персонажа. Две игровые системы плотно связаны с наличием в арсенале игрока наборов инструмента, их появление в инвентаре дает возможность полноценно проводить крафт игровых предметов, и осуществлять ремонт и апгрейд вооружения у персонажей с классом техники.