Путь во мгле является сюжетной модификацией, рассказывающей о приключениях сталкера Савана. Завязка сюжетной линии, как и большинство ключевых квестов происходит на Кордоне. Благодаря использованной платформе Зова Припяти, игра унаследовала полноценную систему апгрейда вооружения и такой класс персонажей как техники, которым для проведения полноценной модернизации оружия и брони необходимы специальные наборы инструмента.
С момента релиза первой версии Сталкер Лост Альфа, игра постоянно эволюционировала и параллельно с геймплейными изменениями в игре менялись и места появления инструментов. Наборы спец. инструмента довольно важный элемент геймплея, на котором основана система апгрейда вооружения и бронекостюмов в игре.
После встречи с дочерью механика Леной, в знак благодарности за свое спасение, Павел берется выполнить её задание. Однажды Лена взяла дорогой заказ, выполнив его она оставила хабар в условленном месте. Заказчик прибыв в указанное место, вместо заказа обнаружил странную записку Шутника, в которой говорилось что весь хабар он разделил на шесть частей и разложил по шести кейсам, спрятав в разных местах.
Находясь на локации Юпитер, нам не раз придется обращаться к ученым, которые базируются, неподалеку от станции Янов. Ученым свойственно периодически подкидывать оригинальные задания главному герою. На этот раз ученый Штерн, предложил Пашке поучаствовать в испытании и настройке нового детектора телепортации.
Прохождение квеста Тайники Военных, начинается сразу после разговора с Седым на станции Янов. Он предлагает Пашке, оказать помощь в поиске секретного архива СБУ, спрятанного военными на Юпитере. Агенты Седого попытались самостоятельно перехватить группу военных, но тщетно, им с боем удалось прорваться в Лиманск.
После встречи Пашки с Седым на Янове, вы получите два задания "Найти карту пути в Лиманск" и поиск секретного архива военных. Вышло так, что военные были вынуждены оставить архивы на Юпитере, а сами с боем были вынуждены прорываться в Лиманск уходя от преследования.
Артефакт Вентилятор довольно редкий и дорогой артефакт, позволяющий обладателю не испытывать жажду. О его существовании мы впервые узнаем на локации Бар от Пилота военного вертолета, сидящего у костра на территории Альянса. Пилот получил артефакт случайно при крушении, в силу сложившихся обстоятельств и соединения нужных элементов.
Общаясь с Леной, главный герой решает проверить услышанную от неё легенду, о существовании уникального и редкого артефакта Горгона. Из рассказов Лены, становиться ясно, что артефакт необходимо искать в Припяти, но точного места никто не знает.
Сталкера Лешего вновь угораздило попасть в неприятную историю. Идя по тропинке ведущей через заповедник Рыжего Леса, ему пришлось столкнуться с двумя кровососами. Не желая испытывать судьбу Леший решил бежать, но по пути под ноги попал камень.
Действия квеста Тайники Альянса разворачивается на локации Юпитер. После получения сообщения от Седого вам предстоит отправиться к нему на станцию Янов и выяснить подробности этой операции. Седой сообщит нам, что Альянс готовит крупную диверсионную операцию на Юпитере.
